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松下村塾四天王のひとりである入江九一を始め、蛤御門の変で亡くなった長州側の人物７人の首塚がある。

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足利将軍家の菩提寺。文久３年の木像梟首事件で三条河原に晒された足利尊氏、義満、義政の３人の木像の他、歴代の足利将軍の木像が安置されている。
また、立命館大学を挟んで北側に位置する等持院墓地には坂本龍馬らに影響を与えた絵師河田小龍の墓がある。